Edhe pse furrat me mikrovalë supozohen të jenë sterile, një studim tregon se shumë mikroorganizma janë rezistues ndaj rrezatimit elektromagnetik intensiv që lëshojnë.
Studiuesit nga Universiteti i Valencia dhe Darwin Bioprospecting Excellence Spanjë morën mostrat nga 30 furra me mikrovalë nga mjedise të ndryshme: kuzhina në shtëpi, zona të përbashkëta si dhomat e pushimit dhe kafenetë, dhe laboratorët. Ata zbuluan mikroorganizma të ndryshëm që jetonin brenda këtyre pajisjeve.
Brachybacterium, Micrococcus dhe Klebsiella u gjetën në të gjitha vendet. Ndërsa disa, si Klebsiella, mund të përbëjnë një rrezik për shëndetin, prania e tyre në furrat me mikrovalë nuk është më shqetësuese sesa në sipërfaqet e tjera të kuzhinës.
Furrat me mikrovalë shtëpiake kishin diversitetin më të ulët mikrobik, sepse ato mund të përballeshin me më pak burime kontaminimi.
Megjithatë, furrat me mikrovalë laboratorike kanë treguar një biodiversitet shumë më të madh, pasi ato përdoren për të ngrohur mostrat biologjike dhe reagjentët kimikë, gjë që krijon një ekspozim të ndryshëm ndaj mikrobeve në krahasim me ushqimin.
Mikroorganizmat, duke përfshirë ato në lëkurën tonë, mund t'i mbijetojnë nxehtësisë dhe rrezatimit nga furrat me mikrovalë, kështu që është thelbësore që të pastrohen plotësisht pajisjet për të ruajtur higjienën dhe për të parandaluar grumbullimin e baktereve.